中国是世界上人口最多的国家，人口与健康研究水平是事关我国国策和经济与社会可持续发展的重大战略问题。建国以来，我国人口与健康研究领域取得了举世公认的成就。但是进入21世纪，我国在该领域还面临着严峻的形势：人口基数大，患者众多；疾病谱较广，发展中国家与发达国家的疾病谱并存；步入老龄化社会，老年保健和老年病的问题日趋严重；现代化进程加快导致的社会心理压力加大，身心疾患激增。此外，由于基础研究积累不够，原始创新成果较少。在重大疾病治疗措施与药物等方面面临着加入WTO所带来的严峻挑战。针对上述国家需求，人口与健康领域应以提高人口出生素质与防治严重危害我国人民健康的重大疾病（如SARS等严重传染病）为主攻方向，以分子与细胞水平的研究为先导，以重大疾病发病机制和防、治中的关键科学问题为突破口。争取在理论与技术上有创新性突破，形成新的防、治体系，使我国在人口与健康领域能够应对各种挑战，促进国民健康，带动学科发展，达到提高生存质量、控制人口数量、加速社会进步的战略目标。力争使我国人口与健康领域的整体研究水平步入世界先进国家行列。
    “十五”后三年重点研究方向是：
1、功能基因组与蛋白质组学
2、健康与疾病发生的分子、细胞和整体的机制研究
3、严重传染病病原生物学、致病机理、疾病控制原理与关键技术的研究
4、生殖、发育与衰老的生物学基础研究
5、环境有害物质对人体健康影响的研究
6、中医理论与创新药物的基础研究
7、重大疾病早期检测、诊断与预警的基础研究